サーバ側ではなくローカル側での話
tortoiseSVN 使ってサーバの情報をローカルに入れてコミットやら更新やらしていたが
database disk image is malformed
というエラーがでて何もできなくなってしまった。
色々調べてみたが一番手っ取り早かったのが .svn ディレクトリをバッサリ消して同じディレクトリにリポジトリを再配置してやったらうまくいった。
未コミット分はしょうがないので別ディレクトリにバックアップしておいて手動復旧。
※こんなの未然に予防とか出来ないよなぁ